Fundado em 06 de Outubro de 2006, o São José Futsal foi criado com o intuito de manter o futsal que estava sendo extinto na cidade de São José dos Campos. Com apoio de Prefeitura de São José dos Campos, o clube do São José Futsal se desenvolveu a ponto que outras instituições do meio de baseiam no modelo de gestão da equipe para seu próprio desenvolvimento. Com pouco tempo de história a equipe ganhou títulos em todos os anos de atuação, algo essencial para a continuidade do esporte.
O São José Futsal teve um inicio sem muitas pretensões. Porém, no ano de 2007, conquistou todos os campeonatos que disputou de forma invicta. Dessa forma firmou-se como uma das principais equipes paulistas em atuação e é visto como uma das equipes com mais potencial em âmbito Nacional. Sob o comando do presidente Roberto Rocha Brandão, o Montanha, o clube chega a 16 anos de história em 2022 com um constante crescimento a cada ano que passa.
A equipe adulta do São José Futsal e Esportes Olímpicos tem por objetivo geral o reconhecimento nacional de sua equipe por meio de vitórias e boas campanhas em campeonatos regionais e nacionais, sempre mantendo sua maneira de gerir o clube com excelência. Para esse fim os atletas são submetidos a treinamentos específicos e constantes ao longo da temporada, feitos por profissionais especializados em suas áreas de atuação.
Atualmente o time disputa os principais torneios profissionais de sua categoria e, ainda, disputa em definitivo a Liga Nacional da Futsal ao adquirir a vaga vitalícia da competição, depois de alugar a mesma por 3 anos consecutivos (2011, 2012 e 2013). O time também disputa a Liga Paulista, um dos principais torneios regionais do Brasil, além de Taça Brasil, Copa Paulista, Jogos Abertos, Jogos Regionais, e Taça Vanguarda.